ワンダリアアプリがあれば、施設内で以下のことができます。
◆生物カードを集める
ファインダーモード（カメラのプレビュー状態）で映像内の生物をロックオンしつづけるとその生物をカードとしてアプリ内に追加することができます。
◆生物の情報を見る
カードフォルダには集めた生物のカードが並びます。好きな生物カードをタップすると、全長・体重などに加えて生物にまつわる楽しいストーリーを読むことができます。
◆生物の写真を撮る
ファインダーモードを通すと生物の周りに肉眼では見えない美しい光のエフェクトを見ることができます。このエフェクトを重ねた状態で生物の写真を撮ることができます。
◆プレゼントがもらえる
アプリ内でカードを集めるミッションを遊べます。ミッションをたくさんクリアできると生物の壁紙や施設内で使えるクーポンなどのプレゼントがもらえます。
◆その他
・撮影した写真の編集やシェア
・デバイスのスペックに合わせて描画品質の変更
・公式チケットサイトで購入したチケットの情報を表示（日本のユーザーのみ／チケット購入時のDeNAアカウントとの連携が必要です）
・集めたカードを残したまま、最初からミッションを遊べる来来訪向けモード
・新しいデバイスへデータを引き継ぐ機能（日本のユーザーのみ／DeNAアカウントとの連携が必要です）